#! /bin/bash ############################################################# # This example show a list of availabel conda environments # ############################################################# ############################################################# # set qsub options # ############################################################# # run in low.q #$ -l low # request enough memory # #$ -l h_vmem=8G,memory=8G,h_stack=8M # Name the job 'Conda-Test' #$ -N Conda-Test # send e-mail after job has finished # use the -M option to define your e-mail address # #$ -M my-email@example.org #$ -m e # join stdout and stderr in one file #$ -j y ############################################################# # initialize conda # ############################################################# __conda_setup="$('/opt/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)" if [ $? -eq 0 ]; then eval "$__conda_setup" else if [ -f "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then . "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" else export PATH="/opt/anaconda3/bin:$PATH" fi fi unset __conda_setup ############################################################# # show conda environments # ############################################################# conda env list