gridengine/local/examples/jobs/simple_conda_test.sh

38 lines
1.2 KiB
Bash
Executable File

#! /bin/bash
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# This example show a list of availabel conda environments #
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# set qsub options #
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# run in low.q
#$ -l low
# request enough memory
# #$ -l h_vmem=8G,memory=8G,h_stack=8M
# Name the job 'Conda-Test'
#$ -N Conda-Test
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# initialize conda #
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__conda_setup="$('/opt/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
eval "$__conda_setup"
else
if [ -f "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
. "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
else
export PATH="/opt/anaconda3/bin:$PATH"
fi
fi
unset __conda_setup
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# show conda environments #
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conda env list