Kasper D. Fischer
fd6c9867f2
This scripts are for testing and to show how to write your own gridengine scripts
38 lines
1.2 KiB
Bash
Executable File
38 lines
1.2 KiB
Bash
Executable File
#! /bin/bash
|
|
|
|
#############################################################
|
|
# This example show a list of availabel conda environments #
|
|
#############################################################
|
|
|
|
#############################################################
|
|
# set qsub options #
|
|
#############################################################
|
|
# run in low.q
|
|
#$ -l low
|
|
|
|
# request enough memory
|
|
# #$ -l h_vmem=8G,memory=8G,h_stack=8M
|
|
|
|
# Name the job 'Conda-Test'
|
|
#$ -N Conda-Test
|
|
|
|
#############################################################
|
|
# initialize conda #
|
|
#############################################################
|
|
__conda_setup="$('/opt/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
|
|
if [ $? -eq 0 ]; then
|
|
eval "$__conda_setup"
|
|
else
|
|
if [ -f "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
|
|
. "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
|
|
else
|
|
export PATH="/opt/anaconda3/bin:$PATH"
|
|
fi
|
|
fi
|
|
unset __conda_setup
|
|
|
|
#############################################################
|
|
# show conda environments #
|
|
#############################################################
|
|
conda env list
|